随着自治区经济快速发展，新增财源扩大，2006年内蒙古财政收支再上新台阶。据初步统计，2006年全区财政总收入712亿元，比2005年增收175.7亿元，增长32.7％，其中：地方财政收入461.9亿元，比2005年增加126.9亿元，增长37.8％；上划中央税收收入250.1亿元，比2005年增加48.8亿元，增长24.2％。各地区财政收入增长普遍较快，继2005年包头市财政总收入突破100亿元之后，2006年鄂尔多斯市、呼和浩特市的财政总收入也突破100亿元。 

   　 2006年全区财政总支出913.5亿元，比2005年增加178.9亿元，增长24％。财政支出进一步向农村牧区、困难地区和城乡困难群众倾斜，对农牧民的直接补贴资金、新型合作医疗财政补助资金，对农村牧区及城市低保户义务教育阶段学生的“两免一补”资金，对城乡居民的社会保障补助资金、就业再就业资金，对财政困难地区的转移支付资金等都有较多增加，体现了公共财政的方向和要求。