缺乏配置标准 统一优惠难落实
　　
　　由于目前我国还没有出台统一的办公用品配置标准，采购人在购置办公用品时，只要不违反《政府采购法》的有关规定，不管是否需要，也不管是否实用，都往高档次和高标准配置，由于品牌和配置的差异，价格往往相差也很大。一方面，不利于节约资金，形成了资产的浪费，另一方面，不利于同类协议供货商品的价格比较，不利于形成统一的优惠价率，也不利于统一的协议优惠价格落实。
　　
　　供应商虚报价 服务承诺难兑现
　　
　　由于协议供货招标与实际供货时间间隔较长，招标时，个别供应商以超低价或高优惠率获取中标，作出超出其承受能力的承诺措施，而在采购人要求供货时，以缺货、无利润等各种理由，要求采购人采购其他型号的产品，从而获得较高的利润。有的甚至与采购人串通，以高利润价格卖出商品或进行服务结算，然后按照承诺的折扣率倒推产品进价或服务市场价。
　　
　　还有些供应商不及时更新价格信息，甚至在一个年度都是一个价格，采购人无法享受到降价的优惠，使得政府采购价反而高于普通消费者购买的价格。还有的供应商以正品的价格或优惠率中标，结果卖给采购人次品，损害采购人利益，因“质次价高”毁损政府采购形象。
　　
　　采购人意识差 制度优势难体现
　　
　　协议供货项目和供应商确定之后，政府采购目录限额内商品和服务的采购，采购人有很大的自主权。但采购人对供应商的选择，往往不是以技术、实力、服务承诺、维修、印刷质量高低为标准，而是以与供应商的关系亲疏为准则。在这种情况下，供应商很难在商品和服务质量上认真履约，协议采购应有的价格和服务优势不能体现。更有甚者，有的采购经办人为了一已私利，与供应商串通一气，或搭购其他物品，或故意将批准采购的物品价格抬高，致使政府采购协议供货节约资金的目标难以实现。
　　
　　供应商标准泛  招标结果难如意
　　
　　协议供应商的确定大多通过公开招标完成，但供应商确定的门槛、考核的内容，评标细节如何确定和把握没有统一的规定，因此，各项目招标内容由采购人和集中采购机构共同确定，尽量采用通用性较强的内容。但由于参与投标的供应商层次不齐，虽然考虑了内容的通用性，仍然存在众口难调的尴尬局面。
　　
　　此外，在评分过程中适度的优惠率不好把握。是以商家的平均报价为适度，还是以市场的某一时段的价格优惠为准，招标机构不好把握，只好根据经验，设定一个平均值，而这一标准值很难说是科学和合理的。因此，导致有的很小的企业以价格优势中标，而相对管理规范履行合同能力强的企业则反而落标。不仅采购人和投标供应商有想法，招标机构也感到结果不甚理想。
　　
　　执行点多面长 监管难落实
　　
　　协议供货存在一定周期，在市场经济条件下，商品品牌层出不穷、价格变化多端，采购人的需求也是多种多样。这样一来，采购人和供应商都很难及时把握市场价格。加之监管队伍中缺乏专业技术人员，对种类繁多的具体协议物品缺乏了解，物价与技监部门也难以全方位控制质量与价格，因此对协议供货价格的监管难到位。
　　
　　部分协议供货产品零部件多、采购次数多，有的项目还超出了协议报价的范围，价格难把握，有的供应商在实际交易时抬高或变相抬高承诺价格、降低服务质量，监管机构在验收核算时也不好把握。
　　
　　违规处罚难执行。由于《政府采购法实施细则》还没有出台，对违反政府采购法规的行为没有具体的处罚措施，使用的法规标准不好把握，同类工作中也没有现存的案例可借鉴，对政府采购违规行为处罚的程序较复杂、时间较长等等，导致了协议供货违规处罚无法执行。