网上投标保证金缴退管理系统会为每一个招标项目自动生成单独的虚拟账号，潜在投标人按虚拟账号从网上缴纳投标保证金。通过网上投标保证金管理系统提交的投标保证金，会自动录入所投标项目保证金专户，实时短信提示投标人资金到账时间，资金来往网上确认，不再需要该交易中心财务人员开具“收款收据”，作为评标委员会判定投标人是否缴纳投标保证金的依据。提交投标保证金名单在项目开标时揭晓，杜绝了现场查看名单泄露投标人名称、数量的可能性。项目招标结束后，该中心工作人员通过系统从网上对投标保证金进行批量退付，投标保证金“来往同路”，即缴纳与退还均是投标人基本账户、同一开户银行、相同账号，确保投标保证金不走偏，安全无风险。